(1) սարքավորումների ընտրություն.Դեղագործական սարքավորումների ընտրության մեջ կան որոշ խնդիրներ, ինչպիսիք են փորձի միջոցով ընտրությունը (առանց փաստացի հաշվարկի կամ տվյալների անբավարար հաշվարկի), առաջխաղացման կույր ձգտումը և ֆիզիկական տվյալների անբավարար ուսումնասիրությունը, որոնք լրջորեն ազդում են սարքավորումների գործնականության և տնտեսության վրա:

(2) սարքավորումների տեղադրում և ուսուցում.Դեղագործական սարքավորումների տեղադրման գործընթացում հաճախ ուշադրություն է դարձվում շինարարության առաջընթացին` անտեսելով շինարարության որակը, ինչը հետագայում հանգեցնում է սարքավորումների պահպանման ծախսերի ավելացմանը:Բացի այդ, սարքավորումների սպասարկման և շահագործման անձնակազմի ոչ պատշաճ վերապատրաստումը նույնպես ռիսկեր է պարունակում դեղագործական սարքավորումների կառավարման և սպասարկման համար:

3) անբավարար ներդրումներ տեղեկատվականացման կառավարման և պահպանման գործում:Մեր օրերում, թեև շատ ձեռնարկություններ մեծ նշանակություն են տալիս սարքավորումների կառավարմանն ու սպասարկմանը, ինչպես նաև սարքավորումների պահպանման գրառումների կառավարմանը և հիմնական պարամետրերի գրանցմանը և արված որոշ խնդիրներին, սակայն որոշ խնդիրներ դեռ կան, ինչպիսիք են՝ դժվար է ապահովել շարունակական սպասարկման տվյալները, արդյունավետության բացակայությունը: Դեղագործական սարքավորումների բնութագրերի մասին տեղեկությունները, ինչպիսիք են բնութագրերը, գծագրերը և այլն, այս անտեսանելին ավելացնում է սարքավորումների կառավարման, սպասարկման և վերակառուցման դժվարությունը:

(4) կառավարման համակարգ.Արդյունավետ կառավարման համակարգի և մեթոդների բացակայությունը, որի հետևանքով դեղագործական սարքավորումների սպասարկման անձնակազմի կառավարումը անբավարար է, սպասարկման անձնակազմի աշխատանքը ստանդարտացման, դեղագործական սարքավորումների կառավարման և սպասարկման գործընթացի բացակայությունը՝ անվտանգության թաքնված վտանգները: